優良的除塵系統，必須有一個適用的，易于掌握的清灰操作控制設施與其配合。合理、正確地進行系統設計和控制需要對工廠工藝過程和除塵器的特性有一個全面的了解，以便對系統的各項參數進行調整控制。

控制系統一般是控制濾袋振打清灰設備的起停周期、振打起動時間的長短，并令其按既定程序或自控程序進行。

除塵器的自動操作清灰，各種設施一定要配備齊全，并和測量指示儀表配合。在除塵器旁應設排風機和振打設備的起動和停車的手動按鈕。按除塵器的間斷或連續操作情況不同，清灰控制的方式也不同。

對于間斷使用的玻纖扁袋除塵器，應確定好清灰周期，將其安排到工藝設備生產的間歇時間，即在除塵器停止使用時進行。應在除塵器的排風機完全停下來以后，再開動振打設備，進行清灰。